Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp8Q80YR6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rbbp8Q80YR6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8Q80YR6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8Q80YR6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8Q80YR6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8Q80YR6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8Q80YR6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8Q80YR6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8Q80YR6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rbbp8Q80YR6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8Q80YR6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8Q80YR6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8Q80YR6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8Q80YR6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8Q80YR6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8Q80YR6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8Q80YR6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8Q80YR6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8Q80YR6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8Q80YR6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rbbp8Q80YR6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbbp8Q80YR6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbbp8Q80YR6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbbp8Q80YR6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rbbp8Q80YR6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp8Q80YR6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rbbp8Q80YR6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rbbp8Q80YR6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp8Q80YR6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp8Q80YR6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms