Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zbed4Q80WQ9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zbed4Q80WQ9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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