Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab3gap1Q80UJ7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Rab3gap1Q80UJ7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab3gap1Q80UJ7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms