Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cep170bQ80U49 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cep170bQ80U49 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cep170bQ80U49 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cep170bQ80U49 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms