Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl29Q80T74 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl29Q80T74 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms