Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT79

Mcph1, Microcephalin, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcph1Q7TT79 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mcph1Q7TT79 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mcph1Q7TT79 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms