Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Atf7ipQ7TT18 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atf7ipQ7TT18 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atf7ipQ7TT18 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms