Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actn1Q7TPR4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms