Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ShprhQ7TPQ3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ShprhQ7TPQ3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ShprhQ7TPQ3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms