Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mycbp2Q7TPH6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mycbp2Q7TPH6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms