Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpf1Q7TND5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpf1Q7TND5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpf1Q7TND5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms