Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tmc8Q7TN58 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmc8Q7TN58 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmc8Q7TN58 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmc8Q7TN58 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmc8Q7TN58 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmc8Q7TN58 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmc8Q7TN58 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmc8Q7TN58 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmc8Q7TN58 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmc8Q7TN58 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmc8Q7TN58 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmc8Q7TN58 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmc8Q7TN58 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmc8Q7TN58 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmc8Q7TN58 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmc8Q7TN58 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmc8Q7TN58 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmc8Q7TN58 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmc8Q7TN58 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmc8Q7TN58 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms