Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GypcQ78HU7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GypcQ78HU7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GypcQ78HU7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GypcQ78HU7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GypcQ78HU7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GypcQ78HU7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GypcQ78HU7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GypcQ78HU7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GypcQ78HU7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GypcQ78HU7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GypcQ78HU7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GypcQ78HU7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GypcQ78HU7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GypcQ78HU7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GypcQ78HU7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GypcQ78HU7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GypcQ78HU7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GypcQ78HU7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GypcQ78HU7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GypcQ78HU7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GypcQ78HU7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GypcQ78HU7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GypcQ78HU7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GypcQ78HU7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GypcQ78HU7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GypcQ78HU7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GypcQ78HU7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GypcQ78HU7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GypcQ78HU7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GypcQ78HU7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GypcQ78HU7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GypcQ78HU7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GypcQ78HU7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GypcQ78HU7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GypcQ78HU7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GypcQ78HU7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GypcQ78HU7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GypcQ78HU7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GypcQ78HU7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GypcQ78HU7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms