Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssh1Q76I79 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ssh1Q76I79 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ssh1Q76I79 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms