Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Chsy1Q6ZQ11 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Chsy1Q6ZQ11 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Chsy1Q6ZQ11 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chsy1Q6ZQ11 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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