Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPE2

Sbf1, Myotubularin-related protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf1Q6ZPE2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sbf1Q6ZPE2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sbf1Q6ZPE2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sbf1Q6ZPE2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sbf1Q6ZPE2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sbf1Q6ZPE2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sbf1Q6ZPE2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbf1Q6ZPE2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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