Protein–RNA interactions for Protein: Q6X1Y6

Asic3, Acid-sensing ion channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic3Q6X1Y6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asic3Q6X1Y6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asic3Q6X1Y6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asic3Q6X1Y6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asic3Q6X1Y6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asic3Q6X1Y6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Asic3Q6X1Y6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Asic3Q6X1Y6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Asic3Q6X1Y6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Asic3Q6X1Y6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Asic3Q6X1Y6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Asic3Q6X1Y6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Asic3Q6X1Y6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Asic3Q6X1Y6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Asic3Q6X1Y6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Asic3Q6X1Y6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Asic3Q6X1Y6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Asic3Q6X1Y6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Asic3Q6X1Y6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Asic3Q6X1Y6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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