Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3E0

Calm5, Calmodulin 5, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm5Q6W3E0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Calm5Q6W3E0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Calm5Q6W3E0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms