Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Opn5Q6VZZ7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Opn5Q6VZZ7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms