Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tfap2eQ6VUP9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tfap2eQ6VUP9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms