Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms