Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Casc1Q6TDU8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casc1Q6TDU8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casc1Q6TDU8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms