Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd300lfQ6SJQ7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd300lfQ6SJQ7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd300lfQ6SJQ7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms