Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT7

Ccsmst1, Protein CCSMST1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccsmst1Q6RUT7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccsmst1Q6RUT7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccsmst1Q6RUT7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms