Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp2b4Q6Q477 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b4Q6Q477 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms