Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nudcd1Q6PIP5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms