Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbtb39Q6PDK0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbtb39Q6PDK0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms