Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SvoplQ6PDF3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms