Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Trak1Q6PD31 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trak1Q6PD31 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms