Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9N8

Trak2, Trafficking protein, kinesin-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak2Q6P9N8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trak2Q6P9N8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trak2Q6P9N8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trak2Q6P9N8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms