Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6I6

Polr2m, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2mQ6P6I6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr2mQ6P6I6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr2mQ6P6I6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr2mQ6P6I6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr2mQ6P6I6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr2mQ6P6I6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Polr2mQ6P6I6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr2mQ6P6I6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr2mQ6P6I6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms