Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc148Q6P5U8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms