Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H2

Nes, Nestin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NesQ6P5H2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NesQ6P5H2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NesQ6P5H2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NesQ6P5H2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NesQ6P5H2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NesQ6P5H2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NesQ6P5H2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NesQ6P5H2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NesQ6P5H2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NesQ6P5H2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NesQ6P5H2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NesQ6P5H2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms