Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrp12Q6P5B0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrp12Q6P5B0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrp12Q6P5B0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrp12Q6P5B0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrp12Q6P5B0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrp12Q6P5B0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rrp12Q6P5B0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp12Q6P5B0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp12Q6P5B0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp12Q6P5B0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp12Q6P5B0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp12Q6P5B0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp12Q6P5B0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp12Q6P5B0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp12Q6P5B0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp12Q6P5B0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rrp12Q6P5B0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rrp12Q6P5B0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrp12Q6P5B0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms