Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kdm2bQ6P1G2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kdm2bQ6P1G2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kdm2bQ6P1G2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm2bQ6P1G2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm2bQ6P1G2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm2bQ6P1G2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm2bQ6P1G2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm2bQ6P1G2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm2bQ6P1G2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm2bQ6P1G2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm2bQ6P1G2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm2bQ6P1G2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm2bQ6P1G2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm2bQ6P1G2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm2bQ6P1G2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm2bQ6P1G2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm2bQ6P1G2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm2bQ6P1G2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm2bQ6P1G2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm2bQ6P1G2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm2bQ6P1G2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm2bQ6P1G2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Kdm2bQ6P1G2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Kdm2bQ6P1G2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Kdm2bQ6P1G2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Kdm2bQ6P1G2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Kdm2bQ6P1G2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kdm2bQ6P1G2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Kdm2bQ6P1G2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Kdm2bQ6P1G2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kdm2bQ6P1G2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kdm2bQ6P1G2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kdm2bQ6P1G2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kdm2bQ6P1G2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kdm2bQ6P1G2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kdm2bQ6P1G2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kdm2bQ6P1G2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kdm2bQ6P1G2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm2bQ6P1G2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm2bQ6P1G2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm2bQ6P1G2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm2bQ6P1G2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm2bQ6P1G2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm2bQ6P1G2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm2bQ6P1G2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm2bQ6P1G2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm2bQ6P1G2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm2bQ6P1G2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm2bQ6P1G2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm2bQ6P1G2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm2bQ6P1G2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms