Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PrimpolQ6P1E7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PrimpolQ6P1E7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms