Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Pprc1Q6NZN1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Pprc1Q6NZN1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Pprc1Q6NZN1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Pprc1Q6NZN1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Pprc1Q6NZN1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Pprc1Q6NZN1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Pprc1Q6NZN1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Pprc1Q6NZN1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Pprc1Q6NZN1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Pprc1Q6NZN1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Pprc1Q6NZN1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Pprc1Q6NZN1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Pprc1Q6NZN1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Pprc1Q6NZN1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Pprc1Q6NZN1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Pprc1Q6NZN1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Pprc1Q6NZN1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Pprc1Q6NZN1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Pprc1Q6NZN1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Pprc1Q6NZN1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Pprc1Q6NZN1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Pprc1Q6NZN1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Pprc1Q6NZN1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Pprc1Q6NZN1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Pprc1Q6NZN1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Pprc1Q6NZN1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Pprc1Q6NZN1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Pprc1Q6NZN1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Pprc1Q6NZN1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Pprc1Q6NZN1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Pprc1Q6NZN1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Pprc1Q6NZN1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Pprc1Q6NZN1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Pprc1Q6NZN1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Pprc1Q6NZN1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Pprc1Q6NZN1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Pprc1Q6NZN1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Pprc1Q6NZN1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Pprc1Q6NZN1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Pprc1Q6NZN1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Pprc1Q6NZN1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Pprc1Q6NZN1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Pprc1Q6NZN1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Pprc1Q6NZN1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Pprc1Q6NZN1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Pprc1Q6NZN1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Pprc1Q6NZN1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Pprc1Q6NZN1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Pprc1Q6NZN1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Pprc1Q6NZN1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Pprc1Q6NZN1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Pprc1Q6NZN1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pprc1Q6NZN1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pprc1Q6NZN1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pprc1Q6NZN1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pprc1Q6NZN1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pprc1Q6NZN1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pprc1Q6NZN1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pprc1Q6NZN1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pprc1Q6NZN1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pprc1Q6NZN1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pprc1Q6NZN1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms