Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpbp1Q6NXH3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpbp1Q6NXH3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms