Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc66Q6NS45 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc66Q6NS45 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc66Q6NS45 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms