Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NipblQ6KCD5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NipblQ6KCD5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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