Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Arhgap20Q6IFT4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Arhgap20Q6IFT4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms