Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Edrf1Q6GQV7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Edrf1Q6GQV7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Edrf1Q6GQV7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 344.5 ms