Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atg9bQ6EBV9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg9bQ6EBV9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg9bQ6EBV9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg9bQ6EBV9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg9bQ6EBV9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg9bQ6EBV9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg9bQ6EBV9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atg9bQ6EBV9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg9bQ6EBV9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg9bQ6EBV9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms