Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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TroQ6DIC6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TroQ6DIC6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TroQ6DIC6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TroQ6DIC6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TroQ6DIC6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TroQ6DIC6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TroQ6DIC6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TroQ6DIC6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TroQ6DIC6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TroQ6DIC6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TroQ6DIC6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TroQ6DIC6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TroQ6DIC6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TroQ6DIC6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TroQ6DIC6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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