Protein–RNA interactions for Protein: Q6A028

Swap70, Switch-associated protein 70, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swap70Q6A028 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Swap70Q6A028 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Swap70Q6A028 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Swap70Q6A028 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms