Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ltn1Q6A009 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ltn1Q6A009 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ltn1Q6A009 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ltn1Q6A009 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ltn1Q6A009 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ltn1Q6A009 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ltn1Q6A009 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ltn1Q6A009 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ltn1Q6A009 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ltn1Q6A009 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ltn1Q6A009 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ltn1Q6A009 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ltn1Q6A009 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ltn1Q6A009 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ltn1Q6A009 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ltn1Q6A009 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ltn1Q6A009 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ltn1Q6A009 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ltn1Q6A009 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ltn1Q6A009 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ltn1Q6A009 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ltn1Q6A009 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ltn1Q6A009 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ltn1Q6A009 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ltn1Q6A009 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ltn1Q6A009 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ltn1Q6A009 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms