Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Jmjd1cQ69ZK6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Jmjd1cQ69ZK6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms