Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf280dQ68FE8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf280dQ68FE8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms