Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF8

Rapgefl1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgefl1Q68EF8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rapgefl1Q68EF8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rapgefl1Q68EF8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rapgefl1Q68EF8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rapgefl1Q68EF8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rapgefl1Q68EF8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rapgefl1Q68EF8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rapgefl1Q68EF8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms