Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab3ipQ68EF0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rab3ipQ68EF0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms